Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Q6

Calr3, Calreticulin-3, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calr3Q9D9Q6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Calr3Q9D9Q6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Calr3Q9D9Q6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Calr3Q9D9Q6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Calr3Q9D9Q6 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Calr3Q9D9Q6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.8 ms