Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9M9

Rnf138rt1, RIKEN cDNA 1700045I19, mousemouse

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Length 248 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf138rt1Q9D9M9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rnf138rt1Q9D9M9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rnf138rt1Q9D9M9 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Rnf138rt1Q9D9M9 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Rnf138rt1Q9D9M9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
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