Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8W5

Psmd12, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 12, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd12Q9D8W5 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Psmd12Q9D8W5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Psmd12Q9D8W5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Psmd12Q9D8W5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Psmd12Q9D8W5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms