Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
AplfQ9D842 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
AplfQ9D842 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
AplfQ9D842 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
AplfQ9D842 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms