Protein–RNA interactions for Protein: Q9D711

Pir, Pirin, mousemouse

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PirQ9D711 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PirQ9D711 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PirQ9D711 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PirQ9D711 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PirQ9D711 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PirQ9D711 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PirQ9D711 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PirQ9D711 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PirQ9D711 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PirQ9D711 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PirQ9D711 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PirQ9D711 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PirQ9D711 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PirQ9D711 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PirQ9D711 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
PirQ9D711 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PirQ9D711 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PirQ9D711 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PirQ9D711 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.8 ms