Protein–RNA interactions for Protein: Q9D646

Krt34, Keratin, type I cuticular Ha4, mousemouse

Predictions only

Length 392 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt34Q9D646 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Krt34Q9D646 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Krt34Q9D646 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Krt34Q9D646 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Krt34Q9D646 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Krt34Q9D646 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Krt34Q9D646 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms