Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4W2

Uncharacterized protein C11orf65 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D4W2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D4W2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D4W2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Q9D4W2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4W2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Q9D4W2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4W2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Q9D4W2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4W2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4W2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Q9D4W2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4W2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4W2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
Q9D4W2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D4W2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D4W2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D4W2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9D4W2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms