Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.2□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.19□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.19□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC8.18□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.18□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.16□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.1
4933428G20RikQ9D3X4 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.15□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.14□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.14□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.13□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC8.12□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
4933428G20RikQ9D3X4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.12□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 127.6 ms