Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3J9

Uncharacterized protein CXorf21 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D3J9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D3J9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D3J9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Q9D3J9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D3J9 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D3J9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D3J9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Q9D3J9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D3J9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D3J9 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Q9D3J9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D3J9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Q9D3J9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Q9D3J9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Q9D3J9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms