Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2E3

4930583I09Rik, RIKEN cDNA 4930583I09 gene, mousemouse

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930583I09RikQ9D2E3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
4930583I09RikQ9D2E3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930583I09RikQ9D2E3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
4930583I09RikQ9D2E3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930583I09RikQ9D2E3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms