Protein–RNA interactions for Protein: Q9D287

Bcas2, Pre-mRNA-splicing factor SPF27, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcas2Q9D287 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Bcas2Q9D287 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Bcas2Q9D287 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Bcas2Q9D287 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas2Q9D287 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas2Q9D287 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas2Q9D287 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Bcas2Q9D287 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcas2Q9D287 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Bcas2Q9D287 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Bcas2Q9D287 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms