Protein–RNA interactions for Protein: Q9D232

Spns3, Protein spinster homolog 3, mousemouse

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Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spns3Q9D232 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Spns3Q9D232 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Spns3Q9D232 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Spns3Q9D232 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Spns3Q9D232 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Spns3Q9D232 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spns3Q9D232 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Spns3Q9D232 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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