Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY94

Gins3, DNA replication complex GINS protein PSF3, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins3Q9CY94 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gins3Q9CY94 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Gins3Q9CY94 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Gins3Q9CY94 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Gins3Q9CY94 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms