Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSU0

Rprd1b, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rprd1bQ9CSU0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Rprd1bQ9CSU0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Rprd1bQ9CSU0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Rprd1bQ9CSU0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms