Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRG1

Tm7sf3, Transmembrane 7 superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tm7sf3Q9CRG1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Tm7sf3Q9CRG1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Tm7sf3Q9CRG1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tm7sf3Q9CRG1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tm7sf3Q9CRG1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms