Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR08

Pop4, Ribonuclease P protein subunit p29, mousemouse

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Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop4Q9CR08 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Pop4Q9CR08 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Pop4Q9CR08 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Pop4Q9CR08 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Pop4Q9CR08 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Pop4Q9CR08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
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