Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPY4

Cdk2ap2, Cyclin-dependent kinase 2-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk2ap2Q9CPY4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk2ap2Q9CPY4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk2ap2Q9CPY4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk2ap2Q9CPY4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk2ap2Q9CPY4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Cdk2ap2Q9CPY4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Cdk2ap2Q9CPY4 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cdk2ap2Q9CPY4 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cdk2ap2Q9CPY4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.1 ms