Protein–RNA interactions for Protein: Q99PU8

Dhx30, Putative ATP-dependent RNA helicase DHX30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dhx30Q99PU8 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dhx30Q99PU8 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Dhx30Q99PU8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Dhx30Q99PU8 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dhx30Q99PU8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dhx30Q99PU8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dhx30Q99PU8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dhx30Q99PU8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dhx30Q99PU8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dhx30Q99PU8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dhx30Q99PU8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dhx30Q99PU8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dhx30Q99PU8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.5 ms