Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN1

Kars, Lysine--tRNA ligase, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KarsQ99MN1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC29.43■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
KarsQ99MN1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC29.37■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC29.33■■■□□ 2.29
KarsQ99MN1 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.31■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.29■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC29.28■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC29.28■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
KarsQ99MN1 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC29.23■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
KarsQ99MN1 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
KarsQ99MN1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.25
KarsQ99MN1 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
KarsQ99MN1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KarsQ99MN1 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
KarsQ99MN1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
KarsQ99MN1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms