Protein–RNA interactions for Protein: Q99M02

March2, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH2, mousemouse

Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
March2Q99M02 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
March2Q99M02 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
March2Q99M02 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
March2Q99M02 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
March2Q99M02 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
March2Q99M02 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
March2Q99M02 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
March2Q99M02 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
March2Q99M02 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
March2Q99M02 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
March2Q99M02 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
March2Q99M02 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
March2Q99M02 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
March2Q99M02 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
March2Q99M02 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March2Q99M02 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
March2Q99M02 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.7 ms