Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM3

Smtnl1, Smoothelin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 459 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smtnl1Q99LM3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Smtnl1Q99LM3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Smtnl1Q99LM3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Smtnl1Q99LM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Smtnl1Q99LM3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Smtnl1Q99LM3 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms