Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN9

Clint1, Clathrin interactor 1, mousemouse

Predictions only

Length 631 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clint1Q99KN9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Clint1Q99KN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Clint1Q99KN9 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Clint1Q99KN9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Clint1Q99KN9 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms