Protein–RNA interactions for Protein: Q99JY1

Tirap, Toll/interleukin-1 receptor domain-containing adapter protein, mousemouse

Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TirapQ99JY1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TirapQ99JY1 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
TirapQ99JY1 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
TirapQ99JY1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
TirapQ99JY1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms