Protein–RNA interactions for Protein: Q925E1

Sntg1, Gamma-1-syntrophin, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sntg1Q925E1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sntg1Q925E1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Sntg1Q925E1 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sntg1Q925E1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sntg1Q925E1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms