Protein–RNA interactions for Protein: Q923A2

Spdl1, Protein Spindly, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spdl1Q923A2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Spdl1Q923A2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Spdl1Q923A2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Spdl1Q923A2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Spdl1Q923A2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Spdl1Q923A2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms