Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y1

Ubxn1, UBX domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 297 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn1Q922Y1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ubxn1Q922Y1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ubxn1Q922Y1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ubxn1Q922Y1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ubxn1Q922Y1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms