Protein–RNA interactions for Protein: Q91W78

Usb1, U6 snRNA phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usb1Q91W78 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Usb1Q91W78 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Usb1Q91W78 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Usb1Q91W78 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Usb1Q91W78 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Usb1Q91W78 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.4 ms