Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Cog3Q8CI04 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cog3Q8CI04 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cog3Q8CI04 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cog3Q8CI04 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog3Q8CI04 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cog3Q8CI04 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog3Q8CI04 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cog3Q8CI04 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms