Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDD9

Lrif1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrif1Q8CDD9 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Lrif1Q8CDD9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Lrif1Q8CDD9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
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Lrif1Q8CDD9 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Lrif1Q8CDD9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
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Lrif1Q8CDD9 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
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Lrif1Q8CDD9 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Lrif1Q8CDD9 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
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Lrif1Q8CDD9 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Lrif1Q8CDD9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Lrif1Q8CDD9 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
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