Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCX5

Krt222, Keratin-like protein KRT222, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt222Q8CCX5 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Krt222Q8CCX5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Krt222Q8CCX5 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Krt222Q8CCX5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Krt222Q8CCX5 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Krt222Q8CCX5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms