Protein–RNA interactions for Protein: Q810P2

Odf3l1, Outer dense fiber protein 3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3l1Q810P2 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Odf3l1Q810P2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Odf3l1Q810P2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Odf3l1Q810P2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Odf3l1Q810P2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms