Protein–RNA interactions for Protein: Q80W85

Npm2, Nucleoplasmin-2, mousemouse

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Npm2Q80W85 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.54■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC37.54■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC37.53■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.53■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC37.52■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.51■■■■□ 3.6
Npm2Q80W85 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC37.49■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC37.47■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.46■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC37.45■■■■□ 3.59
Npm2Q80W85 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.44■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC37.43■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.43■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC37.41■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC37.4■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.58
Npm2Q80W85 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.38■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.38■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC37.37■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.36■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC37.35■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC37.34■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC37.33■■■■□ 3.57
Npm2Q80W85 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC37.31■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC37.28■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC37.27■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
Npm2Q80W85 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.24■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC37.23■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.21■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.21■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC37.2■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.2■■■■□ 3.55
Npm2Q80W85 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Npm2Q80W85 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.19■■■■□ 3.54
Npm2Q80W85 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC37.18■■■■□ 3.54
Npm2Q80W85 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC37.17■■■■□ 3.54
Npm2Q80W85 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.16■■■■□ 3.54
Npm2Q80W85 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC37.15■■■■□ 3.54
Npm2Q80W85 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.14■■■■□ 3.54
Npm2Q80W85 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Npm2Q80W85 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.13■■■■□ 3.53
Npm2Q80W85 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC37.13■■■■□ 3.53
Npm2Q80W85 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.11■■■■□ 3.53
Npm2Q80W85 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Npm2Q80W85 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.08■■■■□ 3.53
Npm2Q80W85 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC37.08■■■■□ 3.53
Npm2Q80W85 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC37.07■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Npm2Q80W85 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.07■■■■□ 3.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 137.9 ms