Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF4

Sdccag8, Serologically defined colon cancer antigen 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdccag8Q80UF4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Sdccag8Q80UF4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Sdccag8Q80UF4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Sdccag8Q80UF4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Sdccag8Q80UF4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Sdccag8Q80UF4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.8 ms