Protein–RNA interactions for Protein: Q6PEM6

Gramd2b, GRAM domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gramd2bQ6PEM6 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gramd2bQ6PEM6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Gramd2bQ6PEM6 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Gramd2bQ6PEM6 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Gramd2bQ6PEM6 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gramd2bQ6PEM6 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms