Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Gpbp1l1Q6NZP2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Gpbp1l1Q6NZP2 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Gpbp1l1Q6NZP2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms