Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSU2

2810408A11Rik, RIKEN cDNA 2810408A11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2810408A11RikQ6NSU2 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
2810408A11RikQ6NSU2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
2810408A11RikQ6NSU2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
2810408A11RikQ6NSU2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.2 ms