Protein–RNA interactions for Protein: Q6A051

Atrnl1, Attractin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atrnl1Q6A051 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Atrnl1Q6A051 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Atrnl1Q6A051 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Atrnl1Q6A051 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Atrnl1Q6A051 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Atrnl1Q6A051 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Atrnl1Q6A051 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atrnl1Q6A051 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Atrnl1Q6A051 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atrnl1Q6A051 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atrnl1Q6A051 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Atrnl1Q6A051 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.1 ms