Protein–RNA interactions for Protein: Q64127

Trim24, Transcription intermediary factor 1-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim24Q64127 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trim24Q64127 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trim24Q64127 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.27
Trim24Q64127 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trim24Q64127 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trim24Q64127 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms