Protein–RNA interactions for Protein: Q62101

Prkd1, Serine/threonine-protein kinase D1, mousemouse

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Length 918 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd1Q62101 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prkd1Q62101 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Prkd1Q62101 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Prkd1Q62101 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Prkd1Q62101 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Prkd1Q62101 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms