Protein–RNA interactions for Protein: Q61818

Rai1, Retinoic acid-induced protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai1Q61818 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Rai1Q61818 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rai1Q61818 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rai1Q61818 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rai1Q61818 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rai1Q61818 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Rai1Q61818 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms