Protein–RNA interactions for Protein: Q5U467

Fbxw20, F-box and WD-40 domain protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxw20Q5U467 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fbxw20Q5U467 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Fbxw20Q5U467 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Fbxw20Q5U467 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Fbxw20Q5U467 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms