Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc92bQ5SUE3 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc92bQ5SUE3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Ccdc92bQ5SUE3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Ccdc92bQ5SUE3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms