Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Ndufaf2Q59J78 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ndufaf2Q59J78 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ndufaf2Q59J78 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ndufaf2Q59J78 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms