Protein–RNA interactions for Protein: Q504M2

Pdp2, MCG53395, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdp2Q504M2 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Pdp2Q504M2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Pdp2Q504M2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Pdp2Q504M2 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Pdp2Q504M2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Pdp2Q504M2 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms