Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZJM7

Otol1, Otolin-1, mousemouse

Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otol1Q4ZJM7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
Otol1Q4ZJM7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Otol1Q4ZJM7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Otol1Q4ZJM7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Otol1Q4ZJM7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Otol1Q4ZJM7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms