Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL71

Sprr2a3, Small proline-rich protein 2A3, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sprr2a3Q4KL71 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.11□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.1□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.09□□□□□ -0.79
Sprr2a3Q4KL71 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.08□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.07□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.06□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.05□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.04□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC10.03□□□□□ -0.8
Sprr2a3Q4KL71 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC10.02□□□□□ -0.81
Sprr2a3Q4KL71 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.8 ms