Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0M1

Gm906, Gene model 906, (NCBI), mousemouse

Predictions only

Length 1,017 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm906Q3V0M1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gm906Q3V0M1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm906Q3V0M1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm906Q3V0M1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Gm906Q3V0M1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Gm906Q3V0M1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms