Protein–RNA interactions for Protein: Q3USQ7

Syndig1l, Synapse differentiation-inducing gene protein 1-like, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1lQ3USQ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Syndig1lQ3USQ7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Syndig1lQ3USQ7 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.03
Syndig1lQ3USQ7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Syndig1lQ3USQ7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms