Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHJ8

Rnf44, RING finger protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf44Q3UHJ8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Rnf44Q3UHJ8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rnf44Q3UHJ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rnf44Q3UHJ8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rnf44Q3UHJ8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf44Q3UHJ8 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf44Q3UHJ8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf44Q3UHJ8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf44Q3UHJ8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf44Q3UHJ8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf44Q3UHJ8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rnf44Q3UHJ8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms