Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGR5

Hdhd2, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd2Q3UGR5 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Hdhd2Q3UGR5 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Hdhd2Q3UGR5 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Hdhd2Q3UGR5 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Hdhd2Q3UGR5 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Hdhd2Q3UGR5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms